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dna测序仪,北京拓普塞斯(在线咨询),测序仪

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测序仪

北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,dna测序仪,公司尤其在 ABI 各种型号的*分析仪方面有丰富的维修维护经验。


测序仪原理:

商用二代测序的方法(method)有不少名字,例如pyrosequencing、I*emiconductor sequencing等等都是商业称谓,但是如果从生化的角度上大体都可归入SBS和/或SBL(取决于使用聚合酶还是连接酶)。序仪的原理到底如何,这个问题实在是太广,详细展开只怕要专门写一本书。我试着从基本逻辑的层面上为大家阐释一下DNA测序的目的和实现手段;具体每一种方法的详细原理稍后再为大家列出一些补充资料。



北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。欢迎您致电联系我们获取更多优惠~~~







测序仪之*/乙醇法纯化pcr产物

北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 ABI 各种型号的*分析仪方面有丰富的维修维护经验。

(1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml ep管中。(2) 加入25μl*/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀dna。12 000r/min于4℃离心30 min,测序仪,小心弃上清。(3) 加70%(v/v)的乙醇50μl洗涤沉淀2次。12 000r/min于4℃离心5min,小心弃上清和管壁的液珠,真空干燥沉淀10~15min。电泳前测序pcr产物的处理(1) 加入12μl的tsr于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解dna沉淀,稍离心。(2) 将溶液转移至盖体分离的0.2ml pcr管中,稍离心。(3) 在pcr仪上进行热变性(95℃ 2min),冰中骤冷,待上机。

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二代测序仪的操作流程

北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 ABI 各种型号的*分析仪方面有丰富的维修维护经验。

1)测序文库的构建(Library C*truction)

  首先准备*组DNA(虽然测序公司要求样品量要达到200ng,但是Gnome Analyzer系统所需的样品量可低至100ng,能应用在很多样品有限的实验中),然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头(Adaptor)。如果是转录组测序,则文库的构建要相对麻烦些,RNA片段化之后需反转成cDNA,然后加上接头,或者先将RNA反转成cDNA,然后再片段化并加上接头。片段的大小(Insert size)对于后面的数据分析有影响,可根据需要来选择。对于*组测序来说,通常会选择几种不同的insert size,以便在组装(Assembly)的时候获得更多的信息。

  2)锚定桥接(Surface Attachment and Bridge Amplification)

  Solexa测序的反应在叫做flow cell的玻璃管中进行,flow cell又被细分成8个Lane,第二代测序仪,每个Lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的DNA 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构,以供后续的预扩增使用。

  3)预扩增(Denaturation and Complete Amplification)

  添加未标记的dNTP 和普通Taq 酶进行固相桥式PCR 扩增,单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性,释放出互补的单链,锚定到附近的固相表面。通过不断循环,将会在Flow cell 的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。

  4)单碱基延伸测序(Single Base Extension and Sequencing)

  在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dNTP 、DNA 聚合酶以及接头引物进行扩增,在每一个测序簇延伸互补链时,每加入一个被荧光标记的dNTP就能释放出相对应的荧光,测序仪通过捕获荧光信号,并通过计算机软件将光信号转化为测序峰,从而获得待测片段的序列信息。

  5)数据分析(Data Analyzing)

  这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分,abi*测序仪,但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列,要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个*组的框架,或者把这些序列比对到已有的*组或者相近物种*组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的结果。


北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。


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